To πρόγραμμά της στη Super League 2 της περιόδου 2023-24 έμαθε η ΑΕΚ Β μετά τη σημερινή κλήρωση της διοργάνωσης. Οι «κιτρινόμαυροι» τοποθετήθηκαν στον Α' Ομιλο μαζί με άλλες 12 ομάδες και θα αρχίσουν την προσπάθειά τους από την Καρδίτσα με αντίπαλο την Αναγέννηση.


Το πρόγραμμα της ΑΕΚ Β στον πρώτο γύρο έχει ως εξής:

1η αγωνιστική: Αναγ. Καρδίτσας - ΑΕΚ Β
2η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Λάρισα
3η αγωνιστική: ΠΑΟΚ Β - ΑΕΚ Β
4η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Αλμωπός Αριδαίας
5η αγωνιστική: Ρεπό
6η αγωνιστική: Λεβαδειακός - ΑΕΚ Β
7η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Νίκη Βόλου
8η αγωνιστική: Απόλλων Πόντου - ΑΕΚ Β
9η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Καμπανιακός
10η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Κοζάνη
11η αγωνιστική: ΠΟΤ Ηρακλής - ΑΕΚ Β
12η αγωνιστική: ΑΕΚ Β - Αιολικός
13η αγωνιστική: Μακεδονικός - ΑΕΚ Β

Στον δεύτερο γύρο οι αγώνες θα παίχθούν σε αντίθετες έδρες στις αντίστοιχες αγωνιστικές.

Την ΑΕΚ Β εκπροσώπησε στην κλήρωση ο Γενικός Αρχηγός της ΑΕΚ Β Ηλίας Ατματσίδης.

Η ΑΕΚ Β, όπως και όλες οι υπόλοιπες Β ομάδες (Ολυμπιακός, Παναθηναϊκός, ΠΑΟΚ) θα συμμετάσχουν κανονικά στα play off για τον τίτλο (θέσεις 1-5) ή στα play out παραμονής (θέσεις 6-11). Οι δύο τελευταίες ομάδες κάθε ομίλου υποβιβάζονται απευθείας στη Γ’ Εθνική. Από αυτή τη σεζόν οι Β ομάδες μπορούν να υποβιβαστούν βάσει της προκήρυξης της διοργάνωσης.