Ο Νίκος Κούστας γεννήθηκε στις 22 Ιανουαρίου 1984 στην Αθήνα. Άρχισε την προπονητική του καριέρα τον Ιούλιο του 2013 στην Κύπρο Κορυδαλλού, την οποία ανέλαβε στην 3η κατηγορία της ΕΠΣΠ και έφτασε μαζί της μια ανάσα από την άνοδο στη Γ’ Εθνική, και ακολούθησε ο Άγιος Ιερόθεος (Μάρτιος 2017 – Νοέμβριος 2017).

Το καλοκαίρι του 2018 ανέλαβε την ΑΕ Μοσχάτου, με την οποία έφτασε στην κατάκτηση του πρωταθλήματος στην Α’ κατηγορία ΕΠΣ Πειραιά (με 29 νίκες και μια ισοπαλία) και στην άνοδο στη Γ’ Εθνική.

Τον Σεπτέμβριο του 2019 κάθισε στον πάγκο της Κηφισιάς, την οποία οδήγησε τη σεζόν 2020 – 2021 στην κατάκτηση του πρωταθλήματος στον 7ο όμιλο της Γ’ Εθνικής και μέσω του «ειδικού πρωταθλήματος» στην άνοδο σε επαγγελματική κατηγορία για πρώτη φορά στην ιστορία της (Super League 2), με ρεκόρ 15 διαδοχικών νικών σε 16 αγώνες.

Τον Ιούλιο του 2022 ανέλαβε τον Πανιώνιο, στην τεχνική ηγεσία του οποίου παρέμεινε έως τις 20 Φεβρουαρίου 2023. Τον Ιούλιο του ίδιου χρόνου ανέλαβε την ΑΕΚ Β.